Ce stage est consacré en très grande partie à l’indexation des polymères dans les fichiers CAPLUS et REGISTRY. Seront étudiés les outils disponibles pour retrouver les polymères (leurs n° CAS) dans REGISTRY et la complémentarité avec des recherches textuelles dans CAPLUS.
La recherche structurale sera aussi abordée.
Par ailleurs la banque de données RAPRA sera décrite en détail (thésaurus, classification…).

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Trois banques de données de réactions chimiques sont disponibles : CASREACT, CHEMINFORMRX et DJSMDS. Les outils de recherche spécifiques mais surtout communs à ces trois fichiers sont étudiés :
Triangle bleu recherche à l’aide d’indicateurs de rôle,
Triangle bleu recherche par groupes fonctionnels,
Triangle bleu recherche structurale (définition des sites réactionnels).
La recherche de réactions dans BEILSTEIN est aussi abordée.
Des exemples de recherches simples mais aussi avancées illustrent l’utilisation de ces différentes techniques.

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Les séquences de protéines et d’acides nucléiques sont interrogeables dans trois banques de données : REGISTRY, DERWENT GENESEQ (DGENE), PCTGEN et USGENE.
Au cours de ce stage, sont décrits les contenus respectifs de chacune de ces banques de données et les différents types de recherche offerts : exacte, sous-séquence, recherche par similarité (Blast, Fasta)...
L’assistant de recherche séquence disponible via STN ON THE WEB est amplement détaillé, ainsi que la fonction « BLAST report » de STN Express.

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Retrouver un numéro de registre CAS, puis ses propriétés physicochimiques, c’est sûrement un problème auquel vous avez été confrontés. STN peut vous apporter la solution.
Au cours de ce stage, vous seront présentés en premier lieu les différents moyens de retrouver le numéro CAS d’une substance à partir d’éléments de la nomenclature (formule brute, fragments de noms…) puis les techniques d’interrogation propres à la recherche de propriétés, soit directement dans REGISTRY mais aussi dans les banques de données factuelles telles que BEILSTEIN, RTECS….

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